Если ssh-порт на сервере не 22, то при мониторинге Zabbix`ом (шаблоном Template App SSH Service) он, естественно, видится down.
Нужно изменить ключ в шаблоне на: net.tcp.service[ssh,,{$PORT}] и прописать макрос в шаблоне как {$PORT}=22, в нужных хостах как {$PORT}=нужный_порт.